依據農業部103年施政方針「健康、效率、永續經營為施政核心，優化農業結構，跨域整合創新加值，發揮農業多功能價值，打造年輕、高競爭力及所得穩定之樂活農業」與「擴大農業科技創新及產業化，建設現代化生產設施；強化農業智慧財產權保護，推動具國際市場利基之農業資材及技術運籌發展，帶動新興科技導入農產業；建構農業雲端整合服務體系，提升經營管理效率」。

農業創新育成中心的整合分工後，將落實育成中心五大功能：

1. 空間與設備
2. 商務支援
3. 行政支援
4. 技術及人才支援
5. 資訊支援

並帶來八大效益：  

1. 減輕創業及創新研發過程的投資費用與風險，提升創新創業之成功率。
2. 協助產業孕育計畫，開發新技術與新產品。
3. 提供產學研合作場域，引導研發成果商品化。
4. 提高研發效率，加速產品開發。
5. 提供輔導能量，協助產業升級轉型。
6. 驅動農、林、漁、牧產業企業聯盟，塑造產業群聚效益。
7. 強化國際合作資源鍵結。
8. 引進創投資源，提供資金挹注，增進企業營運效益。